El término “Alcainça” quizá derive de las palabras árabes “alçai” (que significa reunión) y “néca” (que significa mujeres), mientras que otra fuente indica que procede del árabe al-kanisa, que significa “iglesia”.

La ciudad de Alcainça es probablemente anterior a la fundación de nuestra nacionalidad, como demuestran los restos romanos, visigodos, árabes y medievales encontrados aquí, y en Cabeço dos Moinhos se han hallado vestigios de ocupación humana en la Edad de Bronce.

Las primeras referencias documentales a Alcainça datan de 1270 y 1527. La última referencia menciona la “villa de Alcainça, con sus parejas”, que pertenecía “al término de Sintra” y tenía “un total de 48 vecinos”.

Destaca la iglesia de San Miguel, cuyo documento más antiguo data de 1270. En las décadas centrales del siglo XVII, el conjunto heredado de la época medieval fue sustancialmente alterado, conservándose al parecer sólo parte de la capilla de San Silvestre. La última campaña de construcción tuvo lugar en el siglo XIX.

La capilla del Espíritu Santo fue construida a principios del siglo XVI y tiene la particularidad de poseer una de las portadas manuelinas más importantes del municipio, tipológicamente similar a la de la capilla del mismo nombre de Enxara do Bispo, pero de superior calidad artística y mayor alcance simbólico, ya que ilustra las tres Edades del Hombre y el advenimiento del Espíritu Santo.